Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z175

Loxl3, Lysyl oxidase homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl3Q9Z175 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Loxl3Q9Z175 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Loxl3Q9Z175 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Loxl3Q9Z175 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Loxl3Q9Z175 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms