Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sh3bp5Q9Z131 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sh3bp5Q9Z131 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sh3bp5Q9Z131 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sh3bp5Q9Z131 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sh3bp5Q9Z131 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sh3bp5Q9Z131 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sh3bp5Q9Z131 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sh3bp5Q9Z131 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sh3bp5Q9Z131 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sh3bp5Q9Z131 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sh3bp5Q9Z131 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sh3bp5Q9Z131 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sh3bp5Q9Z131 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sh3bp5Q9Z131 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sh3bp5Q9Z131 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sh3bp5Q9Z131 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms