Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z125

Creb3l1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l1Q9Z125 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Creb3l1Q9Z125 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Creb3l1Q9Z125 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Creb3l1Q9Z125 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l1Q9Z125 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l1Q9Z125 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms