Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbck1Q9WUB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbck1Q9WUB0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbck1Q9WUB0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbck1Q9WUB0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms