Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pus1Q9WU56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pus1Q9WU56 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pus1Q9WU56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pus1Q9WU56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus1Q9WU56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pus1Q9WU56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus1Q9WU56 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms