Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn7Q9R1S8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn7Q9R1S8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn7Q9R1S8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn7Q9R1S8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn7Q9R1S8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms