Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb2Q9R1P3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb2Q9R1P3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb2Q9R1P3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms