Protein–RNA interactions for Protein: Q9R112

Sqor, Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqorQ9R112 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SqorQ9R112 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SqorQ9R112 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SqorQ9R112 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SqorQ9R112 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SqorQ9R112 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SqorQ9R112 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SqorQ9R112 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SqorQ9R112 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SqorQ9R112 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SqorQ9R112 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SqorQ9R112 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SqorQ9R112 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SqorQ9R112 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SqorQ9R112 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SqorQ9R112 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SqorQ9R112 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SqorQ9R112 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SqorQ9R112 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SqorQ9R112 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms