Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Npas3Q9QZQ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Npas3Q9QZQ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas3Q9QZQ0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas3Q9QZQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas3Q9QZQ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Npas3Q9QZQ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Npas3Q9QZQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Npas3Q9QZQ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Npas3Q9QZQ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Npas3Q9QZQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Npas3Q9QZQ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Npas3Q9QZQ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Npas3Q9QZQ0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Npas3Q9QZQ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npas3Q9QZQ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npas3Q9QZQ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npas3Q9QZQ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npas3Q9QZQ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Npas3Q9QZQ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.8 ms