Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gpc1Q9QZF2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc1Q9QZF2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpc1Q9QZF2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpc1Q9QZF2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpc1Q9QZF2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc1Q9QZF2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms