Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rabgef1Q9JM13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rabgef1Q9JM13 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rabgef1Q9JM13 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rabgef1Q9JM13 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rabgef1Q9JM13 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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