Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prg3Q9JL95 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prg3Q9JL95 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prg3Q9JL95 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prg3Q9JL95 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prg3Q9JL95 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prg3Q9JL95 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prg3Q9JL95 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms