Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl39Q9JKF7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl39Q9JKF7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl39Q9JKF7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms