Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacng3Q9JJV5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacng3Q9JJV5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacng3Q9JJV5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacng3Q9JJV5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cacng3Q9JJV5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng3Q9JJV5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacng3Q9JJV5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacng3Q9JJV5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacng3Q9JJV5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacng3Q9JJV5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacng3Q9JJV5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacng3Q9JJV5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacng3Q9JJV5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacng3Q9JJV5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacng3Q9JJV5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacng3Q9JJV5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacng3Q9JJV5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacng3Q9JJV5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms