Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bco1Q9JJS6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bco1Q9JJS6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco1Q9JJS6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bco1Q9JJS6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco1Q9JJS6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms