Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJE7

Fads3, Fatty acid desaturase 3, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fads3Q9JJE7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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Fads3Q9JJE7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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Fads3Q9JJE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fads3Q9JJE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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Fads3Q9JJE7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Fads3Q9JJE7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Fads3Q9JJE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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Fads3Q9JJE7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fads3Q9JJE7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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Fads3Q9JJE7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fads3Q9JJE7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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Fads3Q9JJE7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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Fads3Q9JJE7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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Fads3Q9JJE7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fads3Q9JJE7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fads3Q9JJE7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Fads3Q9JJE7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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Fads3Q9JJE7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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Fads3Q9JJE7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fads3Q9JJE7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms