Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc5a4aQ9ET37 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc5a4aQ9ET37 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc5a4aQ9ET37 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc5a4aQ9ET37 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc5a4aQ9ET37 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc5a4aQ9ET37 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc5a4aQ9ET37 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc5a4aQ9ET37 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc5a4aQ9ET37 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc5a4aQ9ET37 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc5a4aQ9ET37 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc5a4aQ9ET37 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc5a4aQ9ET37 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc5a4aQ9ET37 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc5a4aQ9ET37 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms