Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc4Q9ES56 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc4Q9ES56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc4Q9ES56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trappc4Q9ES56 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc4Q9ES56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc4Q9ES56 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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