Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc28a3Q9ERH8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc28a3Q9ERH8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc28a3Q9ERH8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms