Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dap3Q9ER88 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dap3Q9ER88 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dap3Q9ER88 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms