Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tor1bQ9ER41 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tor1bQ9ER41 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tor1bQ9ER41 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tor1bQ9ER41 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tor1bQ9ER41 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tor1bQ9ER41 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tor1bQ9ER41 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tor1bQ9ER41 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tor1bQ9ER41 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tor1bQ9ER41 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tor1bQ9ER41 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tor1bQ9ER41 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tor1bQ9ER41 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tor1bQ9ER41 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tor1bQ9ER41 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tor1bQ9ER41 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tor1bQ9ER41 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tor1bQ9ER41 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tor1bQ9ER41 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tor1bQ9ER41 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tor1bQ9ER41 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms