Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM3

Nkx2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-4Q9EQM3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx2-4Q9EQM3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-4Q9EQM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-4Q9EQM3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Nkx2-4Q9EQM3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nkx2-4Q9EQM3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nkx2-4Q9EQM3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms