Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cpsf1Q9EPU4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cpsf1Q9EPU4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Cpsf1Q9EPU4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cpsf1Q9EPU4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cpsf1Q9EPU4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cpsf1Q9EPU4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cpsf1Q9EPU4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cpsf1Q9EPU4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cpsf1Q9EPU4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cpsf1Q9EPU4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cpsf1Q9EPU4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cpsf1Q9EPU4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cpsf1Q9EPU4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cpsf1Q9EPU4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cpsf1Q9EPU4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cpsf1Q9EPU4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cpsf1Q9EPU4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cpsf1Q9EPU4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cpsf1Q9EPU4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cpsf1Q9EPU4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cpsf1Q9EPU4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cpsf1Q9EPU4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cpsf1Q9EPU4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cpsf1Q9EPU4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cpsf1Q9EPU4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cpsf1Q9EPU4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cpsf1Q9EPU4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cpsf1Q9EPU4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Cpsf1Q9EPU4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cpsf1Q9EPU4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cpsf1Q9EPU4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cpsf1Q9EPU4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Cpsf1Q9EPU4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cpsf1Q9EPU4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cpsf1Q9EPU4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cpsf1Q9EPU4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Cpsf1Q9EPU4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cpsf1Q9EPU4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cpsf1Q9EPU4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cpsf1Q9EPU4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cpsf1Q9EPU4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cpsf1Q9EPU4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Cpsf1Q9EPU4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cpsf1Q9EPU4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cpsf1Q9EPU4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cpsf1Q9EPU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cpsf1Q9EPU4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cpsf1Q9EPU4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cpsf1Q9EPU4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cpsf1Q9EPU4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cpsf1Q9EPU4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cpsf1Q9EPU4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cpsf1Q9EPU4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cpsf1Q9EPU4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cpsf1Q9EPU4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cpsf1Q9EPU4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cpsf1Q9EPU4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cpsf1Q9EPU4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cpsf1Q9EPU4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cpsf1Q9EPU4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cpsf1Q9EPU4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cpsf1Q9EPU4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cpsf1Q9EPU4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cpsf1Q9EPU4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cpsf1Q9EPU4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cpsf1Q9EPU4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cpsf1Q9EPU4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cpsf1Q9EPU4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cpsf1Q9EPU4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Cpsf1Q9EPU4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cpsf1Q9EPU4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cpsf1Q9EPU4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cpsf1Q9EPU4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Cpsf1Q9EPU4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms