Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr1Q9EPQ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tlr1Q9EPQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr1Q9EPQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr1Q9EPQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tlr1Q9EPQ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms