Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bap18Q9DCT6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bap18Q9DCT6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bap18Q9DCT6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bap18Q9DCT6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bap18Q9DCT6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bap18Q9DCT6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bap18Q9DCT6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bap18Q9DCT6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms