Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc38a3Q9DCP2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc38a3Q9DCP2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc38a3Q9DCP2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc38a3Q9DCP2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc38a3Q9DCP2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms