Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cib4Q9D9N5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cib4Q9D9N5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cib4Q9D9N5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cib4Q9D9N5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cib4Q9D9N5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms