Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf2Q9D8U4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1qtnf2Q9D8U4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf2Q9D8U4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf2Q9D8U4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1qtnf2Q9D8U4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf2Q9D8U4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1qtnf2Q9D8U4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1qtnf2Q9D8U4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qtnf2Q9D8U4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf2Q9D8U4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1qtnf2Q9D8U4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1qtnf2Q9D8U4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1qtnf2Q9D8U4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qtnf2Q9D8U4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qtnf2Q9D8U4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms