Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8Q6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8Q6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D8Q6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D8Q6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms