Protein–RNA interactions for Protein: Q9D820

Prorsd1, Prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prorsd1Q9D820 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prorsd1Q9D820 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prorsd1Q9D820 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prorsd1Q9D820 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prorsd1Q9D820 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prorsd1Q9D820 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prorsd1Q9D820 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prorsd1Q9D820 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prorsd1Q9D820 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prorsd1Q9D820 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prorsd1Q9D820 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prorsd1Q9D820 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prorsd1Q9D820 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prorsd1Q9D820 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prorsd1Q9D820 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prorsd1Q9D820 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prorsd1Q9D820 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prorsd1Q9D820 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms