Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chmp4cQ9D7F7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chmp4cQ9D7F7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp4cQ9D7F7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chmp4cQ9D7F7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chmp4cQ9D7F7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chmp4cQ9D7F7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms