Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Klhl40Q9D783 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Klhl40Q9D783 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Klhl40Q9D783 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Klhl40Q9D783 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Klhl40Q9D783 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klhl40Q9D783 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms