Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slco6d1Q9D5W6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slco6d1Q9D5W6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slco6d1Q9D5W6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco6d1Q9D5W6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slco6d1Q9D5W6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco6d1Q9D5W6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco6d1Q9D5W6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco6d1Q9D5W6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco6d1Q9D5W6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco6d1Q9D5W6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slco6d1Q9D5W6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slco6d1Q9D5W6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms