Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D4W2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D4W2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D4W2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D4W2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D4W2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D4W2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D4W2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D4W2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9D4W2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D4W2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D4W2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D4W2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D4W2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D4W2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D4W2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D4W2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D4W2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q9D4W2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D4W2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D4W2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9D4W2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D4W2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D4W2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9D4W2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D4W2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9D4W2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D4W2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D4W2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms