Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930578G10RikQ9D4Q4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
4930578G10RikQ9D4Q4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930578G10RikQ9D4Q4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms