Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4931423N10RikQ9D4J9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4931423N10RikQ9D4J9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931423N10RikQ9D4J9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931423N10RikQ9D4J9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4931423N10RikQ9D4J9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4931423N10RikQ9D4J9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 844.5 ms