Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem30cQ9D4D7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem30cQ9D4D7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem30cQ9D4D7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem30cQ9D4D7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem30cQ9D4D7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem30cQ9D4D7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem30cQ9D4D7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem30cQ9D4D7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem30cQ9D4D7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms