Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syce1Q9D495 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syce1Q9D495 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syce1Q9D495 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syce1Q9D495 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syce1Q9D495 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syce1Q9D495 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syce1Q9D495 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.1 ms