Protein–RNA interactions for Protein: Q9D416

Arl13a, ADP-ribosylation factor-like protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13aQ9D416 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl13aQ9D416 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arl13aQ9D416 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl13aQ9D416 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl13aQ9D416 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arl13aQ9D416 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arl13aQ9D416 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arl13aQ9D416 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arl13aQ9D416 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl13aQ9D416 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl13aQ9D416 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms