Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Katnal2Q9D3R6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Katnal2Q9D3R6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Katnal2Q9D3R6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Katnal2Q9D3R6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Katnal2Q9D3R6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms