Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ss18l2Q9D174 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ss18l2Q9D174 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18l2Q9D174 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms