Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hddc3Q9D114 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hddc3Q9D114 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hddc3Q9D114 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hddc3Q9D114 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hddc3Q9D114 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hddc3Q9D114 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms