Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C4

Trmt5, tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt5Q9D0C4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt5Q9D0C4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trmt5Q9D0C4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt5Q9D0C4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt5Q9D0C4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt5Q9D0C4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms