Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab3bQ9CZT8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab3bQ9CZT8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab3bQ9CZT8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3bQ9CZT8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms