Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR8

Tsfm, Elongation factor Ts, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsfmQ9CZR8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TsfmQ9CZR8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsfmQ9CZR8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsfmQ9CZR8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TsfmQ9CZR8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms