Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc77Q9CZH8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc77Q9CZH8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc77Q9CZH8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc77Q9CZH8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc77Q9CZH8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc77Q9CZH8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc77Q9CZH8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc77Q9CZH8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc77Q9CZH8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms