Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exo5Q9CXP9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Exo5Q9CXP9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exo5Q9CXP9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exo5Q9CXP9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Exo5Q9CXP9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms