Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc17Q9CXD9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc17Q9CXD9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc17Q9CXD9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc17Q9CXD9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc17Q9CXD9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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