Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx47Q9CWX9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx47Q9CWX9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx47Q9CWX9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx47Q9CWX9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx47Q9CWX9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms