Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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